Commit ac7f585f authored by Joscha Schmiedt's avatar Joscha Schmiedt
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......@@ -4,50 +4,50 @@ This repository contains a proposal for a standardized layout of filesystem fold
```sh
├── 2021_project1
│ ├── 01_project_management
│ │ ├── 01_administration_files
│ │ ├── 02_accepted_grants
│ │ ├── 03_meeting_notes
│ │ ├── 04_related_literature
│ │ ├── 05_data_management_plans
│ │ └── 06_notes
│ ├── 02_materials_and_methods
│ │ ├── 01_protocols
│ │ │ └── 001_protocol1
│ │ │ └── method.yaml
│ │ ├── 02_code
│ │ │ └── code.yml
│ │ └── README_MaterialsMethods.md
│ ├── 03_raw_data
│ │ ├── 001_dataset1
│ │ │ ├── LICENSE
│ │ │ └── dataset.yml
│ │ └── README_RawData.md
│ ├── 04_processed_data
│ │ ├── 001_processed_data
│ │ │ ├── LICENSE
│ │ │ └── dataset.yml
│ │ └── README_ProcessedData.md
│ ├── 05_data_analysis
│ │ ├── 001_dataset1_analysis
│ │ ├── 990_code_libraries
│ │ ├── LICENSE
│ │ └── README_DataAnalysis.md
│ ├── 06_figures
│ │ ├── 001_dataset1_figures
│ │ ├── 990_shared_figures
│ │ └── README_Figures.md
│ ├── 07_publications
│ │ ├── 01_conferences
│ │ ├── 02_manuscripts
│ │ ├── 03_other
│ │ └── README_Publications.md
│ ├── 08_misc
│ └── project.yml
└── README.md
│ ├── 01_project_management
│ │ ├── 01_administration_files
│ │ ├── 02_accepted_grants
│ │ ├── 03_meeting_notes
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│ │ │ └── 001_protocol1
│ │ │ └── method.yaml
│ │ ├── 02_code
│ │ │ └── code.yml
│ │ └── README_MaterialsMethods.md
│ ├── 03_raw_data
│ │ ├── 001_dataset1
│ │ │ ├── LICENSE
│ │ │ └── dataset.yml
│ │ └── README_RawData.md
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│ │ ├── 001_processed_data
│ │ │ ├── LICENSE
│ │ │ └── dataset.yml
│ │ └── README_ProcessedData.md
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│ │ ├── 001_dataset1_analysis
│ │ ├── 990_code_libraries
│ │ ├── LICENSE
│ │ └── README_DataAnalysis.md
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│ │ ├── 001_dataset1_figures
│ │ ├── 990_shared_figures
│ │ └── README_Figures.md
│ ├── 07_publications
│ │ ├── 01_conferences
│ │ ├── 02_manuscripts
│ │ ├── 03_other
│ │ └── README_Publications.md
│ ├── 08_misc
│ └── project.yml
└── README.md
```
When the folder structure was evaluated, a template for automatic folder generation via the [Python Cookiecutter](https://cookiecutter.readthedocs.io) will be provided.
A template for automatic folder generation via the [Python Cookiecutter](https://cookiecutter.readthedocs.io) is available in the subfolder `cookiecutter-research-data`.
## References
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